根據《國立東華大學校長遴選辦法》第七條，校長遴選委員會分成三階段進行遴選：

1. 第一階段
   從被推薦與自我推薦的人選中遴選並徵詢被推薦人參選意願後決定3~6位候選人參與第二階段。
2. 第二階段
   現行法規將第一階段選出的候選人的資料上網公佈，邀請候選人來到學校並舉行座談會。
   由教師與研究人員行使同意權認可投票 。候選人若超過有同意權人的五分之二(含)以上同意便可以進入第三階段。 ​
3. 第三階段
   遴選委員會邀請通過第二階段的候選人進行面談。再由遴選委員會選擇一位候選人函報教育部，此位候選人就是東華的新校長了喔！